Les échantillons doivent être dissous dans un peu de solvant (mélange précis de chloroforme et d'éthanol) dans un tube à essai et prélevés avec un capillaire pour être déposés délicatement sur une croix à 1cm du bord inférieur de la plaque (préalablement marquée au crayon), on voit la goutte de solvant qui s'évapore et on dépose 2 trois fois un petit volume de liquide. Le but est d'avoir la tache la plus petite et la plus concentrée possible.
Nous avons donc deux croix contenant des échantillons invisibles à l'oeil nu.
On dépose la plaque verticalement dans un bécher contenant 0,5cm d'éluant (mélange précis de chloroforme, acétate de butyle, acide formique) qu'on referme par un verre de montre et on attend.
On voit bien l'éluant mouiller progressivement la plaque, on arrête lorsqu'il atteint un niveau à 1 cm du bord supérieur, on marque ce front de solvant au crayon. On laisse un peu sécher la plaque puis on va observer où sont arrivés les deux échantillons grâce à une lampe à UV (les échantillons contenant une fonction phényle sont visibles aux UV), on les entoure au crayon sur la plaque ce seront nos références.
Pour utiliser la lampe à UV, il faut porter des lunettes spéciales... 
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